Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms