Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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RabggtbP53612 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RabggtbP53612 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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