Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BckdhaP50136 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 336.5 ms