Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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VegfbP49766 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VegfbP49766 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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VegfbP49766 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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VegfbP49766 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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VegfbP49766 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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VegfbP49766 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfbP49766 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfbP49766 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms