Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms