Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myo1bP46735 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myo1bP46735 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms