Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtlP38585 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms