Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin1P35438 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms