Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TbpP29037 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TbpP29037 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TbpP29037 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TbpP29037 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TbpP29037 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TbpP29037 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TbpP29037 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TbpP29037 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TbpP29037 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TbpP29037 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TbpP29037 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TbpP29037 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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