Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp3P28862 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms