Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms