Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atxn10P28658 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atxn10P28658 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atxn10P28658 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn10P28658 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms