Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb3P28231 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb3P28231 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms