Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb1P28230 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms