Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CftrP26361 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CftrP26361 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CftrP26361 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CftrP26361 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms