Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms