Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nfkb1P25799 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms