Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NdnP25233 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NdnP25233 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NdnP25233 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms