Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gja1P23242 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja1P23242 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja1P23242 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms