Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb2P21619 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms