Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klra1P20937 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klra1P20937 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klra1P20937 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms