Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VimP20152 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VimP20152 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VimP20152 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms