Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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NelfeP19426 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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NelfeP19426 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NelfeP19426 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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