Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NefhP19246 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NefhP19246 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NefhP19246 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms