Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp53P15975 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms