Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms