Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nid1P10493 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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