Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms