Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06330 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P06330 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06330 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06330 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P06330 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06330 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06330 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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