Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms