Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosP01101 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosP01101 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosP01101 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FosP01101 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosP01101 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms