Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BlmO88700 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BlmO88700 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
BlmO88700 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BlmO88700 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BlmO88700 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BlmO88700 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms