Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp4O70480 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp4O70480 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms