Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms