Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlkO54988 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlkO54988 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms