Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms