Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FxnO35943 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms