Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms