Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms