Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clk2O35491 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Clk2O35491 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Clk2O35491 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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