Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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