Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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