Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmiO35309 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmiO35309 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms