Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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