Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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