Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm2888K7N746 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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