Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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BC024978J3QPC3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC024978J3QPC3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC024978J3QPC3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC024978J3QPC3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC024978J3QPC3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC024978J3QPC3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC024978J3QPC3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC024978J3QPC3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BC024978J3QPC3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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