Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem200cJ3QK46 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms