Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms