Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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